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1月22日,在一项发表于Journal of Medical Virology的最新研究中,北京大学、广西中医药大学、宁波大学和武汉生物工程学院组成的研究团队报道了关于新型冠状病毒2019-nCoV的新发现: 1.2019-nCoV可能是蝙蝠冠状病毒与一种未知来源的冠状病毒的重组病毒; 2.蛇是最有可能携带2019-nCoV的野生动物; 3.刺突糖蛋白内的同源重组或许有助于新型病毒从蛇到人的跨物种传播。 全基因组序列检测于1月7日确定此次病毒为新型冠状病毒后,1月10日,第一例2019-nCoV的基因组测序完成,这使得研究人员能够开发出用于检测病毒RNA的逆转录-聚合酶链反应,同时也能够根据2019-nCoV的基因组追溯其起源。 研究团队重建系统发生树后指出,2019-nCoV可能是蝙蝠冠状病毒与一种未知的冠状病毒的重组病毒。由于另一种病毒的基因组无法与现有数据库进行对比,因此其来源仍然未知。同源重组过程发生在刺突糖蛋白内,这类蛋白负责识别细胞表面受体。这是这个过程,促进了病毒的跨物种传播。 为了确定新型冠状病毒2019-nCoV的病毒库,研究团队将2019-nCoV与不同动物的相对同义密码子使用度(RSCU)偏性进行了序列分析与对比。不同物种在蛋白质编码过程中,倾向使用的同义密码子不同,甚至存在很大的差异,这样的差异就是RSCU偏性。由于病毒与宿主的RSCU偏性具有可比性,因此对RSCU偏性的研究,有助于找出2019-nCoV的潜在宿主。 这项研究使用银环蛇与舟山眼镜蛇进行RSCU分析,其与2019-nCoV的偏性分别为12.77与14.70。相比之下,其他动物与2019-nCoV的偏性都在24以上。因此,蛇与2019-nCoV的转录机制最为接近。研究据此提出,蛇是最有可能携带2019-nCoV的野生动物,造成此次新型病毒肺炎暴发的可能性也最大。刺突糖蛋白内的同源重组,或许有助于新型病毒从蛇到人的跨物种传播。
不同动物与新型病毒的RSCU偏性对比示意图 目前,病毒在人群间的有限传播(传播力不及SARS),研究者提出了两种可能性:一方面,这可能同样与刺突糖蛋白中的同源重组有关;另一种可能性是,新型病毒是由蛇传至人体。由于蛇是冷血爬行动物,体温低于人体,因此病毒传播至人体时,效力可能下降。但我们必须保持警惕:随着病毒在人体中适应,后代具备更强的传播能力,2019-nCoV的人传人速度可能加快。 研究也指出,目前人们还没有在动物中发现2019-nCoV。明确新型病毒的动物库,有助于揭示重组的来源,以及人群间的潜在传播机制。
(本站节选自环球科学) |